В архиве хранятся дела постоянного хранения, который не подлежат передаче в муниципальный архив (картотеки на судебные дела, алфавитки, акты о выделении дел к уничтожению, паспорт архива и др.) Нужно ли заводить для них отдельную опись дел постоянного хранения? Или достаточно того, что они включены в сдаточые описи?

Согласно Правилам все дела постоянного и долговременного (свыше 10 лет) сроков хранения подлежат полному оформлению с составлением описей дел. Другое дело, что перечисленные Вами дела и документы относятся к переходящим делам, либо входят в состав переходящих дел, которые ведутся в течение многих лет и подлежат передаче в муниципальный или государственный архив при ликвидации организации. Поэтому работайте с картотеками, пополняйте дело фонда, а перед сдачей в муниципальный архив надо будет оформить эти дела.