Добрый день, напомните,пожалуйста, в делах постоянного срока хранения ( у нас это протоколы заседаний, отчеты бухг.годовые, сметы, акты приема передачи, журналы некоторые) где обязательно нужна внутренняя опись?

Протоколы как раз не надо. Они у вас идут по номерам и все. Надо если только протоколы в деле собраны разных коллегиальных органов. Надо если формулировка названия дела например, такая: документы (письма, отчеты, доклады) по подготовке заседаний кредитного комитета